Wielka Wojna Ojczyźniana trwała nadal, ale na tle zwycięskiego natarcia Armii Czerwonej decyzja Rady Komisarzy Ludowych z 21 stycznia 1945 r. o zorganizowaniu w Moskwie Ogrodu Botanicznego, poświęconego 220. Akademii Nauk ZSRR, zapoczątkowało nową erę twórczego pokojowego życia.
Za datę założenia Głównego Ogrodu Botanicznego uważa się przyjęcie 14 kwietnia 1945 roku przez Prezydium Akademii Nauk ZSRR szczegółowego programu budowy Ogrodu Botanicznego. A w maju tego samego roku na realizację projektu przeznaczono obszar 361,35 ha masywu leśno-parkowego Ostankino.
Akademik Nikołaj Wasiljewicz Tsitsin był założycielem i pierwszym dyrektorem Głównego Ogrodu Botanicznego przez trzydzieści pięć lat. Układ ogrodu opracował architekt I.M. Pietrowa pod kierunkiem akademików N.V. Tsitsina i A.V. Szczusew.
Dziesięć lat po śmierci założyciela, w 1991 roku, Główny Ogród Botaniczny Akademii Nauk otrzymał imię akademika Tsitsina. W 2014 roku teren Ogrodu Botanicznego został włączony do WOGNu.
Do dziś Główny Ogród Botaniczny. NV Tsitsina Rosyjskiej Akademii Nauk pozostaje jednym z najwybitniejszych ogrodów botanicznych w Europie, a jego głównym zadaniem jest nadal zachowanie puli genowej roślin oraz opracowywanie teoretycznych podstaw i metod wprowadzania i aklimatyzacji roślin w celu racjonalnego wykorzystania światowych zasobów roślinnych.
Żywe kolekcje Ogrodu obejmują ponad 8220 gatunków oraz 8110 form i odmian roślin, a na ich podstawie, stosując nowoczesne techniki architektury krajobrazu, stworzono ekspozycje botaniczne roślin: naturalnej flory Rosji, byłego ZSRR, arboretum, ekspozycja roślin tropikalnych i subtropikalnych, kwietno-ozdobnych i uprawnych.